FPG

מדמה אוכלוסייה של גודל קבוע
הורד עכשיו

FPG דירוג וסיכום

פרסומת

  • Rating:
  • רישיון:
  • Freeware
  • שם המפרסם:
  • Jody Hey
  • מערכות הפעלה:
  • Windows All
  • גודל הקובץ:
  • 65 KB

FPG תגים


FPG תיאור

שם FPG עומד על סימולציה גנטית קדימה. FPG מדמה אוכלוסיית גודל מתמיד שעובר תהליכים אבולוציוניים שונים, כולל: מוטציה, רקומבינציה, בחירה טבעית והגירה. המשמעות של "קדימה" בהקשר זה היא פשוט באותו זמן, בתוך סימולציה, נע קדימה בדיוק כפי שהוא עושה בעולם האמיתי. זה בניגוד לסימולציה גנטית של האוכלוסייה, כפי שמוצג בתוך הסימולציה, ממשיך בחזרה אל העבר. סימולציות קשורות יש יתרונות רבים, אבל הם מסוחררים אם הם משלבים בחירה טבעית על אתרים מרובים. FPG שימושי להערכת ההשפעה של הברירה הטבעית על דפוסי וריאציה גנטית. זה מתוכנן כדי להיות מסוגל להניח מצבים בעולם האמיתי עם גודל אוכלוסייה גדול למדי ושיעורי מוטציה גבוהים על פני משותף ארוך של DNA. מודל המוטציה הוא מודל אתרים אינסופיים, כלומר, אין אתר המפריד באוכלוסייה יכול לקבל מוטציה נוספת. הדמיה מתאימה מוטציות נייטרליות, מועילות ומזיקות תחת מספר דגמי כושר שונים, כולל מודלים כושר תוספים, כפולים ואפיוניים. התוכנית מייצרת מגוון רחב של ניתוחים, כולל רמות פולימורפיזם, הטרוזוגיות (נצפתה וצפויה), שיעורי קיבוע, ו disquilibrium הצמדה - כל אלה נערכים עבור כל אחד כמה קטגוריות של מוטציה. כאשר הגירה מופעלת, מספר ניתוחים לגבי מבנה האוכלוסייה מתבצעים .. מחזור החיים הבסיסי חלופי בין הגנומס הפלואיד (gametes) ודיפלואידים (Zygotes), ולהמשיך כדלקמן: - gametes הם מזויפים באופן אקראי לתוך Zygotes - כושר נמדד עבור כל זיגוט כפונקציה של המוטציות שהוא נושא. אם הדומיננטיות מוגדרת ל -0.5, אז המודל דומה ברוב המובנים למודל הבחירה של הפלואיד. - הצלחה הרבייה היא מספר Gametes תרמו לדור הבא, והוא נקבע עבור כל Zygote על ידי ציור מתוך התפלגות רב-תחומית עם ציפיות כי הם ערכי כושר יחסית של כל בכיתה כושר. - רקומבינציה ומוטציה מתרחשות במהלך הייצור של gametes - אם יש אוכלוסיות מרובות, Gametes נמשכים אקראי מכל אוכלוסייה והניח באקראי לתוך אוכלוסיות אחרות. אלה gametes כי הם נעקרו על ידי מהגרים אבודים, כך הגירה מוסיפה מרכיב נוסף של נסחף גנטי. זהו איים מודל של הגירה - Zygotes חדשים נוצרים על ידי איחוד אקראי של gametes. הדורות אינם חופפים.


FPG תוכנה קשורה

Simdiv

יצירת ערכות נתונים תחת בידוד עם מודל הגירה ...

264 103 KB

הורד