 | DIST4Siteתוכנית לאיתור אתרי חומצות אמינו משומרות |
| הורד עכשיו | |
DIST4Site דירוג וסיכום
פרסומת
DIST4Site תגים
- לזהות גַלַאִי חוּמצָה חומצה טיטרציה גופן חומצה מקושרי קובץ גילוי עסקת חומצה ניתוח חומצות גרעין יישור רצף מרובה למצוא חומצות אמינו חומצת אמינו Finder. חפש חומצת אמינו Anal Analyzer חומצה רצף חומצות אמינו חומצת אמינו חומצת אמינו מתרגם נושא חומצה לחלץ חומצות אמינו פתרון חומצה חומצות אמינו שאריות חומצת אמינו אופטימלית רצף חומצה גרעין ניתוח חומצות אמינו חומצות גרעין לנתח זוג חומצות אמינו חומצות אמינו חומצת אמינו ניתוח רצף ניתוח רצף חומצות אמינו סיווג חומצות אמינו חומצת אמינו טופולוגיה אמינו-חומצה גלאי לזהות חומצה אמינו מצא מירנה משומרת שומר מירנה Finder. החיפוש שומר מירנה לנתח שרשרת חומצות אמינו לולאות חומצה עסקאות חומצה חומצה פרו Acid Pro 7 קובץ צנצנת ניידים sc4lot simcity 4 אדריכל תנין תוכנה פרוטלבופ PC המרת SD2F. PST Viewer פתוח Pinacle Videospin 1.1. נוקיה N70 Softweare. נירון דולבי ר ' פרימו כותב pdf ATI VGA X300E. חינם bubblet עבור
DIST4Site תיאור
DIST4SITE פותחה כדי להיות תוכנית לאיתור אתרי חומצות אמינו שימור על ידי מחשוב שיעור אבולוציוני יחסית עבור כל אתר ברצף מרובים יישור (MSA). סקירה: שיעור האבולוציה אינו קבוע בקרב אתרי חומצות אמינו: כמה עמדות מתפתחות לאט והן נקראות בדרך כלל "משמרות", בעוד שאחרים מתפתחים במהירות והם מכונים "משתנה". וריאציות התעריף מתאימות לרמות שונות של מבחר טיהור בפועל באתרים אלה. הבחירה הטיהור יכולה להיות תוצאה של אילוצים גיאומטריים על קיפול החלבון לתוך מבנה 3D, אילוצים באתרי חומצות אמינו המעורבים בפעילות אנזימטית או ביגנד מחייב או, לחילופין, באתרי חומצות אמינו לקחת חלק אינטראקציות חלבון חלבון . DIST4SITE מחשבת את שיעור האבולוציוני היחסי בכל אתר באמצעות מודל אבולוציוני המבוסס הסתברותי. זה מאפשר לקחת בחשבון את התהליך stochastic הבסיס האבולוציה של רצף בתוך משפחות חלבון ואת עץ phylogenetic של החלבונים במשפחה. ציון השימור באתר מתאים לשיעור האבולוציוני של האתר. מתודולוגיה: הקלט החובה היחיד לדרג 4SITE הוא קובץ MSA. התוכנית מחשבה אז עץ פילוגנטי עולה בקנה אחד עם MSA זמין (המשתמש יכול גם להזין עץ מחושב מראש). לאחר מכן הוא מחשב את ציון השימור היחסי עבור כל אתר ב- MSA. זה מתבצע באמצעות שיטה אימפירית אמפירית או שיטת סבירות מקסימלית (Pupko et al., 2002).
DIST4Site תוכנה קשורה
