Cvit הצג כרומוזומים בעזרת כלי זה
הורד עכשיו

Cvit דירוג וסיכום

Cvit תגים

צוֹפֶה נוף כרומוזום רצף הגנום

Cvit תיאור

CVIT, קצר עבור כלי צפייה כרומוזום מיועד ליישום Perl שניתן להשתמש בהם כדי ליצור במהירות תמונות PNG המציגים תכונות על מגוון של מפות או על רצפים גנומיים. זה בכוונה פשוטה ולא אינטראקטיבית, אם כי ניתן לעטוף cvit בפנים, לדוגמה, דפי אינטרנט אינטראקטיביים. הקלט מורכב מקבצי נתונים או יותר בפורמט GFF3. הנתונים חייבים להכיל רשומות המתארות "כרומוזומים" אחת או יותר "(אשר עלולים לייצג קבוצת הצמדה, Psuedomolecule, BAC, Contig, כל סוג של רציף של DNA, או אפילו מבנה חלבון). אלה "כרומוזומים" הם עמוד השדרה כי התכונות ממוקמות. CVIT יציג כל מערכת קואורדינטות רציפה, כולל זוגות בסיס, סנטימורגנים (מפות גנטיות) וסנטימקלינטוקס (מפות ציטוגנטיות). הקואורדינטות עשויות לרוץ קדימה (הקטן ביותר לגדול) או לאחור (הגדול ביותר לחטיפים). הפלט מורכב תמונה PNG של הכרומוזום (ים) ותכונות, תמונה אגדה, ורשימת קואורדינטות תכונה.

Cvit תוכנה קשורה