Caryoscope

ויזואליזציה של נתוני ביטוי בהקשר שלם של הגנום.
הורד עכשיו

Caryoscope דירוג וסיכום

פרסומת

  • Rating:
  • שם המפרסם:
  • Ihab A.B. Awad
  • מערכות הפעלה:
  • Windows All
  • גודל הקובץ:
  • 7 MB

Caryoscope תגים


Caryoscope תיאור

CaryOscope הוא רכיב UI ג 'אווה לשימוש חוזר קבוצה של כלי ניתוח, כלי שורת הפקודה ויישום GUI לצפייה בנתוני ביטוי גנים בהקשר לגנום שלם. CaryOscope היא חבילת תוכנה המאפשרת לך להציג ולחקור נתונים מספריים כפונקציה של מיקום גנומי. לדוגמה, CaryOscope שימש ל "לצייר" נתונים microarray על מערכת של כרומוזומים, כך שינויים במספר העתק DNA יכול לזהות אזורים של אובדן כרומוזום או שכפול בתוך הגנום של תאי הגידול (1) : 41-6). בנוסף, נתונים Microarray מדידת רמות ביטוי MRNA יכול להיות גם לדמיין בהקשר גנומי באמצעות Caryoscope (PNAS 2002 דצמבר 10, 99 (25): 16144-9). נתונים שנצפו עם CaryScope לא צריך להיות מוגבל לנתונים microarray - כל סוג של נתונים מספריים שניתן לייצג כפונקציה של מיקום גנומי יכול להיות דמיינו באמצעות caryoscope. קבל caryoscope ולתת לו לנסות לראות מה זה הכל על!


Caryoscope תוכנה קשורה