 | Bowtie עבור לינוקסbowtie עבור לינוקס הוא Ultrafast, זיכרון יעיל קצר קריאה קצר |
| הורד עכשיו | |
Bowtie עבור לינוקס דירוג וסיכום
פרסומת
- רישיון:
- Freeware
- שם המפרסם:
- Ben Langmead
- אתר האינטרנט של המוציא לאור:
- מערכות הפעלה:
- Linux
- גודל הקובץ:
- 13.40MB
Bowtie עבור לינוקס תגים
Bowtie עבור לינוקס תיאור
פרסומת Bowtie עבור לינוקס היא בית וחינוך תוכנה שפותחה על ידי בן Langmead. לאחר המשפט והבדיקה שלנו, התוכנה הוכחה להיות רשמית, מאובטחת וחופשית. הנה תיאור רשמי עבור bowtie עבור לינוקס: ערוך על ידי bowtie עבור לינוקס הוא Ultrafast, זיכרון יעיל קצר לקרוא קריאה. הוא מיישר רצפים קצרים DNA (קורא) לגנום האנושי בשיעור של 25 מיליון קורא לשעה על תחנת עבודה טיפוסית עם 2 gigabytes של זיכרון. Bowtie מדדים את הגנום עם אינדקס תלבושות-וילר כדי לשמור על טביעת הרגל הזיכרון שלה קטן: 1.3 GB עבור הגנום האנושי. הוא תומך במדיניות יישור שווה ערך MAQ וסבון אבל הוא הרבה יותר מהר: על 35x מהר יותר מאשר MAQ מעל 350x מהר יותר מאשר סבון כאשר מיישמים את הגנום האנושי. מאפיינים: תוקן את כל הבעיות הידועות עם אפשרויות - הם עכשיו לעבוד כראוי עם חוטים מרובים. בעיה קבועה שבה רצף ואיורים התהפכו לפעמים. סובלים נושאים אחרים שגורמים להחלטה מזויפת של קורא בלתי מסודרות. נוסף - MAXFA / - אפשרויות MaxFQ אז זה קורא כי לא ליישר בשל מגבלת -M ניתן לזרוק בנפרד מקריאות כי לא ליישר בכלל. פלט יישור מובטחת כעת להיות "דטרמיניסטית" גם כאשר נעשה שימוש בחוטים מרובים. כלומר, בהתחשב באותה קלט קורא (בכל סדר) ואותו - הוא, Bowtie יפיק את אותם יישורים בכל פעם שהוא מופעל, אם כי לא בהכרח באותו סדר. זה לא מחזיק בגרסאות שונות של bowtie. מספר תיקוני באגים נוספים.
Bowtie עבור לינוקס תוכנה קשורה
