Blastalign

ייישר רצפי נוקליאוטידים
הורד עכשיו

Blastalign דירוג וסיכום

פרסומת

  • Rating:
  • רישיון:
  • Freeware
  • שם המפרסם:
  • Aris Katzourakis
  • מערכות הפעלה:
  • Windows All
  • גודל הקובץ:
  • 180 KB

Blastalign תגים


Blastalign תיאור

היישום BLUSTALIG משתמש ב הפיצוץ NCBI כדי ליישר רצפים נוקליאוטיד כי יש אינדילס גדול (הוספת / מחיקות) או קשה אחרת ליישר גלובלי. התוכנית בוחרת את רצף הייצוג ביותר מרצף קלט ולאחר מכן מחלץ את שאילתת הפיצוץ מעוגנת יישור מרובה (ב Nexus ו Phylip פורמטים). לחלופין, המשתמש יכול לבחור איזה רצף להשתמש כעוגן. התוכנית גם תפוקת מטריקס המייצג אזורים של הומולוגיה לאורך רצפים, אשר ניתן להשתמש בו כדי לזהות חזותית subgroups שיתוף אינדילס גדול במיוחד. תוכנית נוספת, BLISTALIGNP משתמשת ב- Tblastn כדי ליישר רצפי נוקליאוטידים לרצף ייחוס יחיד חומצת אמינו, המאפשר מסגרת קריאה פתוחה להישמר במספר יישור.


Blastalign תוכנה קשורה

Ctree

עריכת שומנים עצים פילוגנטיים וקלות. ...

236 1.9 MB

הורד