Bioimagexd. זהו תוכנה חופשית, קוד פתוח לניתוח והדמיה של תמונות ביו-רפואיות רב-ממדיות
הורד עכשיו

Bioimagexd. דירוג וסיכום

Bioimagexd. תגים

לְנַתֵחַ צוֹפֶה נוף תצוגת נתונים רב-ממדית רַב מֵמָדִים להציג תמונה ביו לנתח תמונה ביו-רפואית תמונה ביו-רפואית ויזואליזציה תוכנה. הדמיה מקור נתונים. לפתח תוכנה להדמיה נתונים רב-ממדיים נתונים רב-ממדיים תוכנה ויזואליזציה תהליך ביו-רפואי תמונות MRI ויזואליזציה ניתוח תמונות MRI. ביו-רפואית

Bioimagexd. תיאור

BIOIMAGEXD היא חבילת תוכנה לעיבוד, ניתוח ודמיינו נתוני תמונה רב-ממדיים. כמו השם מרמז, התוכנה מיועדת בעיקר עבור נתונים ביולוגיים, למשל תמונות מיקרוסקופיות confocal של תאים חיים, אבל זה מתאים לחלוטין לעבודה עם כל סוג של נתוני תמונה רב מימדיות. BIOIMAGEXD יש ממשק משתמש פשוט, אינטואיטיבי המבוסס על חלון גדול אחד, ואת הפעולות שלה תוכננו להיות עקביים ופונקציונליים. BIOIMAGEXD יציע פונקציות מתקדם קלט / פלט ומצבי ויזואליזציה מרובים (החל פשוט 2D פרוסת תצוגה כדי מתקדם 3D טיוח). אלה יכולים להיות משולבים בחופשיות עם כל אחד מצד מצבי משימה רבים (כולל ערוץ מיזוג, ניתוח קולוקליזציה, תיקון אינטנסיביות מסננים שונים להסרת רעש, פילוח, מעקב, מדידות וכו '). מובנה באנימרט מאפשר לך ליצור נעים מדהימים כפי שיש לו שליטה מלאה של שינויים נקודת זמן פאתם מצלמה וצפייה זוויות. תכונות עיקריות: תמונה צופה: נתונים פתוחים בפורמטים מיקרוסקופיים נפוצים (או תמונות או ערימות של תמונות וסדרת זמן), ומציגים את תמונת הנתונים לפי תמונה. עיבוד תמונה: התאמת צבע / בהירות / בניגוד / גמא, שינוי צבע או לוח של מערך נתונים / ערוץ, לסנן את הרעש, נכון עבור הלבנה פלואורסצנטי בנתוני סדרת זמן. 3D עיבוד נפח: DATASETS 3D יכול להיות נפח אינטראקטיבי שניתנו סרט ביצוע: השתמש במודול האנימטור כדי להגדיר נתיב מצלמה סביב נתוני התלת-ממד שלך, ולעשות סרט של זה מסתובב ולעוף למרות התקרבות בכל דרך שאתה אוהב. נתונים סדרת זמן נתמכים: "נתונים 4D". ניתוח Colocalisation: אנו יודעים את כל הביולוגים התא באמצעות מיקרוסקופיה confocal תמיד מחפשים colocalisation! כלי colocalisation שלנו מאפשר לך לנתח את colocalisation של עוצמת האות במערכת נתונים רב ערוצית 3D, הימנעות מבעיה של colocalisation שווא לראות תמונות z- מחסנית הקרנה, ולבצע כמה ניתוחים סטטיסטיים שנותנים לך מספרים קשים על הסכום והאיכות של colocalisation בנתונים שלך. משתמש באלגוריתמים דומים לאלה ב- ImageJ, למשל את תוסף WCIF עבור סף קולקליזציה אוטומטית, תוך שימוש בשיטת עוזרים ואח ' AFM תמונה צופה: מיקרוסקופית כוח אטומי וטכניקות הדמיה קשורות להפוך את התמונות שניתן לשרת כמו משטחים 3D. אנחנו יכולים גם להוסיף כמה מסנני תמונה שימושי וכדומה. אולי יש איזה סוג של צורה AFM - PDB או Cryoem מבנה / מודל מתאים כלי. Comaprison של תאים משטח גובה תמונות עם DataSets 3D confocal. Multiprocessor, מחשוב מקביל, אשכולות וחשוב: כחלק מפרויקט FINHPC אנו מתכננים לאפשר bioimagexd להפעלת עיבוד תמונה ופונקציות אחרות במקביל עם קוד וקטורית ספציפי CPU (Altivec / מהירות מנוע ב- G4 ו- G5, ו- MMX SSE SSE3 ב- IX86), על שולחן העבודה מחשבים, אשכולות, תחנות עבודה, שרתים ומחשבים סופר בעלי זיכרון משותף גדול

Bioimagexd. תוכנה קשורה