Bambeניתוח Bayesian ביולוגיה מולקולרית ואבולוציה | |
הורד עכשיו |
Bambe דירוג וסיכום
פרסומת
- רישיון:
- Open source
- שם המפרסם:
- Donald Simon & Bret Larget, Department of Mathematics and Computer Science, Duquesne University.
- מערכות הפעלה:
- Windows
- גודל הקובץ:
- Free
- תאריך הוצאה:
- 2021-05-15 20:54:20
Bambe תגים
- ספריית ביולוגיה ביולוגיה מולקולרי האבולוציה המולקולרית בייסיאנית בייסיאני ביולוגיה מולקולרית סימולטור האבולוציה אבולוציה ביולוגיה סטטיסטית ביולוגיה חישובית Netsian Nets. צור רשת Bayesian. תמיכה ברשת Bayesian. הקשורים לביולוגיה שומר מסך ביולוגיה סיוע ביולוגיה כלי ביולוגיה מולקולרית סיווג bayesian נאיבי ללמוד רשת Bayesian. לדמות אבולוציה ביולוגיה כלי ניתוח מולקולרי אומדן bayesian phylogeny. ביולוגיה מודלים חישוביים ניתוח נתונים מיקרו-ביולוגי מִיקרוֹבִּיוֹלוֹגִיָה ביולוגיה התנהגותית עורך רשת Bayesian. עריכת רשת Bayesian. ביולוגיה של התא הדמיית ביולוגיה יישור Bayesian. הקרן לביולוגיה מערכת ביולוגיה אייקון ביולוגיה לפתור רשתות Bayesian. פותר בייס נטס צפה באייזיאן Nets. Bayesian AnalISIS. יישום שיטה בייס שיטת Bayesian. לנתח טקסט ביולוגיה מציג ביולוגיה ביולוגיה מבנית ניתוח בייסיאני ניתוח עץ בייס Bayesian MCMC ניתוח אבולוציה מתכנסת כלי ביולוגי אבולוציוני אבולוציה MKDV. סינון Bayesian. חינם Flash Player. Keyman Amharic תוכנה. תוכנת גוגל מפות חינם מוסיקה ניידת Nokia N73 תוכנה צנצנת תוכנה חינם Java Mp4. תוכנת צ'אט פייסבוק
Bambe תיאור
השם Bambe מייצג ניתוח Bayesian ביולוגיה מולקולרית ואבולוציה. Bambe פותחה להיות חבילת תוכנה חופשית עבור ניתוח bayesian של phylogenies. החבילה כוללת תוכניות לניתוח נתוני ה- DNA מיושר או RNA ומאפשרות לנתונים עם פערים או באתרים בלתי מוגדרים. התוכנית העיקרית משתמשת במגוון של אלגוריתמים של המטרופולין-הייסטינגס למדגם מן ההפצה האחורית המשותפת של עצים פילוגניניים ופרמטרים של סבירות. תוכניות אחרות בעזרת ההפצה בניתוח של עצים שנדגמו וערכי פרמטרים. הערה: כולם מקבלים הרשאה להעתיק ולהשתמש בחבילת תוכנה זו ואת התיעוד הנלווה לשימוש אקדמי אישי תכונות עיקריות: בחירה של מודלים סבירים. HKY85 (Hasegawa-Kishino-yano, 1985) F84 (כפי שיושם בפיליפ של Felsenstein) TN93 (Tamura-Nei, 1993) בחירה של Metropolis-Hastings Samplers להציע עצים פילוגנטיים חדשים (כולל גרסת הפצה חדשה של Beta Scaled של מקומי). Metropolis-Hastings Samplers להציע פרמטרים מודל חדש. הבחירה של דוגמים נפרדים לשרוף והסקה. מפרט גמיש של קטגוריות אתר עם ערכי פרמטר נפרדים עבור כל קטגוריית אתר. בחירה כדי לאתחל את החיפוש בעץ אקראי, עץ Upgma, עץ ההצטרפות לשכן, או עץ מוגדר על ידי המשתמש. שני פורמטים (Bambe and Newick) לקריאה ולכתיבת עצים. HTML עזרה קבצים. גרפית בזמן אמת ניטור של פרמטרים עץ ודגם.
Bambe תוכנה קשורה