Asatura להפגין רוויה ברצפי נוקליאוטידים
הורד עכשיו

Asatura דירוג וסיכום

Asatura תגים

סדר פעולות אפקט הרוויה שסתום שסתום רִוּוּי רוויה מעצב אלגוריתם הרוויה רוויה קלטת סימולציה רווי שוויה שחורה רוויה Adjuster. כוונן את הרוויה לשנות רוויה לתקן רוויה שינוי רוויה מותנה שוויה פוטושופ 3D כוכב הלכת גנרטור. Nucleotide פרופורציה מוּטָצִיָה מסלול רווי רצף נוקליאוטיד מנהל רצף נוקליאוטיד נוקליאוטיד שטרת שנאי רוויה סימולטור רוויה אנלוגית לשנות את הרוויה שינוי שוויה תקין תקין דגם החלפת נוקליאוטידים מוטיב נוקליאוטיד לְהַפְגִין תחליף נוקליאוטיד ביאור נוקליאוטיד יישור נוקלאוטיד פולימורפיזמים נוקליאוטידים מוטציה נוקליאוטיד חלק נוקלאוטיד שומר מסך איי פסיפיק חינם Java אנטי וירוס קובץ Codec FLV. SWF ל FLA. איך לקרוא ביטורנט לייט לשרבט קפיצה 1.8.2. יאהו וידאו Roxxana. ולהיפך צק נהג BlackBerry 1800 תוכנה קריוקי שיר CDG.

Asatura תיאור

הדרך הרגילה להפגין רוויה ברצפי נוקליאוטידים היא העלילה את חלק ההבדלים בין רצפים נגד המרחק האבולוציוני המפריד ביניהם. כאשר מספר ההבדלים הנצפים, למשל את חלקם של עמדות קודון שלישי, כבר לא מגדיל עם מרחק אבולוציוני הולך וגדל, רצף הוא אמר להיות רווי. אותה טכניקה יכולה להיות מוחלת על חומצת אמינו (AA) רצפים. פיתחנו יישום Java בשם Asatura כי מפלה תחליפים AA עם הסתברויות גבוהות ונמוכות של התרחשות. כל תחליפי AA מוגדרים כמו "תכופים" או כמו "נדיר" בהתאם ההסתברויות המוטציה שלהם, אשר מוסק מ מטריצות ההסתברות החלפת, כגון pam ידועה ו blosum. אלה 20 על ידי 20 מטריצות לספק את ההסתברויות הנגזרות אמפירית של AA אחד מוחלף על ידי עוד אחד כאשר רצפים יש diversged מעל מרחק אבולוציוני מסוים. יישום ASATARA ימיין את כל התחליפים על פי ההסתברויות הללו ואת הערך של הסתברות "ניתן לבחור כי מבדיל בין תחליפים תכופים ונדירים. עבור כל זוג רצף, התוכנית ממהר מספר תחליפים תכופים ונדירים שנצפו כנגד המרחק האבולוציוני שלהם. על ידי שינוי ערך ההסתברות של ההסתברות החלפתית, מספר תחליפי AA מסווגים כצפוי או נדיר. באופן אידיאלי, בחירה זהירה של "לחתוך את הערך" מחלק את הנתונים המקוריים להגדיר לתוך רווי ולא רווית. מלבד מטריצות ההסתברות להחלפה הנפוצה ביותר, כגון PAM, Blosum, MTREV24 ו JTT, מטריצות מוגדרות למשתמש ניתן להשתמש גם.

Asatura תוכנה קשורה