ANC-GENE. מסקנות של רצפי גנים אבות על ידי שיטת Bayesian מבוסס מרחק
הורד עכשיו

ANC-GENE. דירוג וסיכום

ANC-GENE. תגים

סדר פעולות בייסיאני מנוע היקש גֵן מערכת מסקנות מטושטשת רצף נוקליאוטיד בעיה להסיק פסולת וריאציה עורך רשת Bayesian. עריכת רשת Bayesian. הסקה יישור Bayesian. מסקנות הפלוטיפיות כלי הסקה Bayesian AnalISIS. יישום שיטה בייס שיטת Bayesian. ניתוח בייסיאני ניתוח מבוסס מרחק Phylogeny מסקנות ג 'ין אבות אשכול גן אבות מסקנת גזע גדולה Bayesian MCMC ניתוח רצף ג'ין מסקנת סטטיסטית אבות

ANC-GENE. תיאור

יישום ANC-Gene פותחה כדי להיות כלי שורת פקודה קטנה עבור מסקנות של אקדח נוקליאוטיד רצפים של גנים קידוד חלבון של קבוצה של רצפים היום הנוכחי אשר יחסים phylogenetic ידועים. התוכנית הראשונה מסכמת את חומצות האמינו על ידי שיטת Bayesian מבוסס המרחק, ולאחר מכן מפרים את רצפי נוקליאוטידים הבסיסית על ידי תיקון חומצות אמינו מוסק. כדי להשתמש בתוכנית, אתה צריך קובץ קלט המכיל את רצפי ה- DNA ואת טופולוגיית עץ של רצפים אלה (ראה Rnase.Seq עבור דוגמה). קובץ זה מתחיל עם שני מספרים: מספר רצפים ומספר נוקליאוטידים לכל רצף (אורך רצף). השורה השנייה תהיה שם הרצף הראשון, והקו השלישי יהיה הרצף הראשון, וכן הלאה. רק A, T, C, G, A, T, C ו- G מותר ברצפים. ברצפים יש להיות מיושר פערים או כל סימנים אחרים יוסרו. השורה האחרונה של הקובץ היא טופולוגיית עץ של רצפים. פורמט העץ הוא זהה לזה בשימוש בחבילת Phylip (Felsenstein 1995). שים לב כי העץ הוא unroated, ולכן המעבר במקום לא reshation נדרש עבור הצומת העמוק ביותר.

ANC-GENE. תוכנה קשורה