צ 'ק

יישום זה כולל מטרה כללית מספר רצף יישור התוכנית עבור DNA או חלבונים.
הורד עכשיו

צ 'ק דירוג וסיכום

פרסומת

  • Rating:
  • רישיון:
  • Freeware
  • שם המפרסם:
  • The European Bioinformatics Institute
  • מערכות הפעלה:
  • Windows All
  • גודל הקובץ:
  • 4.7 MB

צ 'ק תגים


צ 'ק תיאור

Clustal X היא תוכנית מתקדמת שעוסקת ברצף מרובים יישור עבור חלבונים ו- DNA. עוצב כמו GUI עבור Clustalw, התוכנית מבצעת בניתוח רצף מעמיק, בעוד גם מציע כלי עזר רבים כדי לבצע השוואות נאותות.עמיסת פורמטים מתמחים במספר הוא מסוגל לעבוד עם רצפים מוכנים, מיובאים קבצים של פורמטים הבאים: EMBL / Swissprot, NBRF / PIR, Pearson (Fasta), GCG / MSF (Pileup), Clustal (* .aln), GCG9 / RSF ו- GDE. במהלך תהליך היבוא, צביעה x מנסה לזהות האם רצפים הם נוקליאוטידים או חומצות אמינו, אבל אין ערובה בפועל כי הבחירה תהיה נכונה. הדגשת אלמנט חשובים בקובץ המקור נטען, יישור הרצף יוצג בחלון הראשי של התוכנית. ערכת הצביעה המובנית משמשת להדגיש את התכונות המשמרות, מה שהופך אותן לפוצץ דרך צבעים חיים. על מנת להבחין בין תוכן הרצפים, מומלץ להשתמש בגופן גדול יותר; זה יגרום להציג רצף zoomed, מה שמקל על הרכב שלה. תהליכי יישור קל פעולות המותרות על ידי התוכנית לעשות את הרשימה; אתה יכול לצרף רצף ליישור קיים, לחתוך או להדביק שבר, כמו גם כדי לחפש מחרוזת או להסיר פערים קיימים. כמו כן, באפשרותך לבצע יישור באמצעות אחת מהשיטות הבאות: השלם (הרצף יעבור ניתוח מלא), מדריך עץ בלבד או התכנסות של רצפים שנבחרו ו / או טווחי שאריות. מומלץ כי לפני תחילת תהליך יישור, אתה אפס את כל הפרמטרים (פערים חדשים, פערי חלבון) על מנת שהתוצאות להיות חד משמעיות. לנתח נתונים ולקבל ציון איכות יישור של המעיד החשוב ביותר של הניתוח יהיה ציון איכות יישור, אשר זממו עבור כל עמודה בנפרד. ציון גבוה מייעד עמודה משומרת היטב, בעוד רמות שימור נמוכות מסומנות על ידי ציון נמוך יותר. למסקנה, הניתוח תלוי במגוון פרמטרים, שיש להגדיר בהתאם למטרה המדעית שצריך לבצע. בהחלט, התוכנית עושה בחירה מצוינת עבור מדענים, כמו גם סטודנטים אשר מחפשים לעשות ספק מתוך רצף DNA. נבדקו על ידי אנדריאה Matei, עודכן לאחרונה ב 21 ביולי, 2014


צ 'ק תוכנה קשורה

עלינו