פונזי מצא סמנים עם כלי זה
הורד עכשיו

פונזי דירוג וסיכום

פונזי תגים

סַמָן קַרטוֹגרָפִיָה גנטיקה

פונזי תיאור

Fonzie הוא יישום Informatics מבוסס Python שנוצרו עבור התמחות קרטוגרפיה גנטית. Fonzie מאפשר לך למצוא סמנים על קבוצה של רצפים לשייך oligonucleotides גם כן. Fonzie שיחות Tandem חזור על Finder על הקלט גרעין ברצף קובץ (Fasta Format). כל סמן מוקרן לגבי קריטריונים שונים (גודל, אחוז התאמות, נוכחות באזורים ספציפיים של רצף הקלט). לאחר מכן, הרגישות של סמן הוקמה על ידי ביצוע הפיצוץ נגד מסד נתונים של רצפים גרעין (הכוללים את קובץ הקלט). ניתן ליצור מסד נתונים זה לפני השימוש בפונזי. בשלב הבא, זוגות פריימר מתוכננים, באמצעות Primer3, עבור סמנים שנבחרו. פונזי ואז לבדוק את הרגישות של מוצר הגברה באמצעות הפיצוץ נגד מסד הנתונים. קבצי הפלט של Fonzie הם קובץ טקסט מופרד טאב כולל נתונים על סמנים ו Primers, קובץ DAT שהוא הפלט של TRF ו 3 ספריות המכילות בהתאמה, רצף סמן Fasta, רצף המוצר הגברה Fasta ו קובץ נתונים קובץ עבור כל סמן.

פונזי תוכנה קשורה