סאטולטיפור haplotype להסיק מנתוני SNP unphased ב polyploids heterozygous מבוסס על שבת
הורד עכשיו

סאטולטיפור דירוג וסיכום

סאטולטיפור תגים

מנוע היקש מערכת מסקנות מטושטשת האתר שלי SNP לנתח את אתר SNP האפלוטיפ הערכה אומדן האפלוטיפ נפוץ הפלוטיפ צייר haplotype. צבע הפלוטיפ הפלוטיפ סמני SNP. SNP תג גנוטיפ SNP פסולת וריאציה הסקה עץ הפלוטיפ מסקנות הפלוטיפיות מפעיל בוליאני polyploid הטרוזיגי הטרוזיגי כלי הסקה חיפוש SNP הורד SNP SNP מסנן ניתוח SNP microarrays. Phylogeny מסקנות תאר את הפלוטיפ רצף להפלוטיפ ניתוח הפלוטיפי ניתוח בלוק הפלוטיפי בדיקת האגודה הפלוטיפית מסקנת גזע גדולה זיהוי SNP אסוציאציה להפלוטיפ נתוני הפלוטיפ Y-chromosomal haplotype Affymetrix SNP מערכים

סאטולטיפור תיאור

Satlotyper הוא כלי תוכנה המיועד להסיק haplotypes מ polyploid ו polyalelic unphased נתונים SNP. Satlotyper משתמש במפעילים בוליאני ומשתנים לגבש haplotype מסקנות על ידי parsytion טהור (HIPP) עבור הבעיה בוליאני ססוק (SAT). עבור מציאת הסדרה המרוחקת ביותר של הסבר של הפלוטיפים, Satlotyper מתחילה בהנחה שהסביר את הפלוטיפ ומגדיל את מספר הפלוטיפים עד שנמצא. מאז SAT הוא NP-Complete, זה לא יכול להיות מובטחת כי פתרון נמצא בזמן סביר עבור נתונים נתון. עם זאת, בדיקות אמפיר הראו כי ניתן לחשב מסקנות עבור נתונים מן העולם האמיתי. יתר על כן, Satlotyper מעניק אילוצים פתרונות חלופיים והיא מסוגלת לייעל את הסבירות לתוצאה באמצעות הליך Bootstrapping. תן satlotyper לנסות לראות כמה שימושי זה באמת יכול להיות בשבילך!

סאטולטיפור תוכנה קשורה