מחוגי RDM. תוכנית להפוך את ניתוח השוואתי של מבנה משני RNA
הורד עכשיו

מחוגי RDM. דירוג וסיכום

מחוגי RDM. תגים

אָנָלִיזָה מִבְנֶה RNA אצווה RNA התקנות משניות מִשׁנִי יַחֲסִי RNA World. RNA כדי Aminoacid. RNA פולימראז מבנה RNA. ניתוח השוואתי ניתוח פילוגנטי ניתוח מבנה View RNA מבנה משני RNA מבנה משני הצופה מבנה RNA ויזואליזציה אוטומציה ניתוח הליך RNA-SEQ ניתוח נתונים מבנה RNA לפענח RNA. תוכנית משנית מבנה משני RNA. מפת השוואתית הצופה ניתוח רצף RNA. צייר מבנה RNA משני ליצור מבנה RNA. גנרטור מבנה RNA חיזוי מבנה משני צופה גנומי השוואתי דמיינו גנומיקה השוואתית RNA מבנים משניים ניתוח RNA. לנתח נתונים השוואתיים ניתוח נתונים השוואתי. ניתוח מבנה המוח יישור RNA. ניתוח מבנה תקופתי ניתוח מבנה נתונים. RNA אונטולוגיה קונסורציום RNA עמוד השדרה nomenclature. השכלה תיכונית דיאגרמות השוואתיות

מחוגי RDM. תיאור

יישום מעגלים RDM נועד להיות תוכנית Windows ניסיוני להסיק מבנה משני RNA באמצעות השיטה ההשוואתית. ניתוח השוואתי הוא השיטה המועדפת של מבנה משני של RNA, אך השימוש בו דורש מומחיות ניכרת ומאמץ ידני. כמו החשיבות של המבנה המשני עבור יישור רצף מדויק ניתוח phylogenetic הופך להיות יותר ויותר, הצורך במודלים מבנה משני עבור קבוצות טקסונומיות מגוונות הופך לדחוף יותר. התאמת משקל מקסימלית (MWM) היא גישה תיאורטית גרף להסיק RNA מבנה משני המציג הבטחה ניכרת. זה לוקח כקלט קבוצה של ציונים זיווג בסיס שניתן נגזר ממגוון מקורות, כגון שיקולי אנרגיה חופשית, מידע הדדי או נתונים ניסיוניים. נתונים אלה יכולים להיות מיוצגים כגרף מתקפל שבו הקודקודים הם עמדות יישור, ואת הקווים או הקצוות המחברים זוג קודקודים מקבלים משקל פרופורציונלי לכמות הראיות עבור התאמה זו. תואם הוא subgraph של גרף מתקפל שבו לא קודקוד מחובר יותר מאשר קודקוד אחד אחר. ההתאמה עם משקל הקצה הכולל הגדול ביותר הוא נלקח להיות האומדן הטוב ביותר של מבנה RNA. התאמה זו יכולה לכלול מידע על מבנה משני ושלישוני, כגון pseudokinots. MWM יכול מאוד להאיץ את התהליך של ניתוח מבנה השוואתי של רצפים RNA, ונבדק בהצלחה על TRNA, SRP RNA, ו 16s RRNA רצפים.

מחוגי RDM. תוכנה קשורה