לְהִתְכַּנֵס

התפתחות מתכנסת ומקבילה ברמת רצף חומצת האמינו
הורד עכשיו

לְהִתְכַּנֵס דירוג וסיכום

פרסומת

  • Rating:
  • רישיון:
  • Freeware
  • שם המפרסם:
  • Jianzhi Zhang
  • מערכות הפעלה:
  • Windows All
  • גודל הקובץ:
  • 48 KB

לְהִתְכַּנֵס תגים


לְהִתְכַּנֵס תיאור

יישום זה פותחה כדי לבדוק התפתחות מתכנסת מקבילה ברמת רצף חומצות אמינו. היא מחשבת את ההסתברויות כי התחליפים המתכנסים והמקבילים ביותר מיוחסים לסיכוי אקראי. חבילה זו מכילה תוכנית אחת: Converg2.exe, אשר נכתב בשפה C. כדי להשתמש בתוכנית, אתה צריך קובץ קלט המכיל את רצפי חומצות אמינו ואת טופולוגיית עץ של רצפים אלה (ראה Lysozyme.Aa לדוגמה). קובץ זה מתחיל עם שני מספרים: מספר רצפים ומספר אתרי חומצות אמינו (אורך רצף). השורה השנייה תהיה שם הרצף הראשון, והקו השלישי יהיה הרצף הראשון, וכן הלאה. רק קוד אות אחד (מהוון) עבור 20 חומצות האמינו מותר ברצפים. ברצפים יש להיות מיושר פערים או כל סמלים אחרים להיות מוסר כבר. השורה האחרונה של הקובץ היא טופולוגיית עץ של רצפים. פורמט העץ הוא זהה לזה בשימוש בחבילת Phylip (Felsenstein 1995). שים לב כי העץ הוא unroated, ולכן המעבר במקום לא reshation נדרש עבור הצומת העמוק ביותר.


לְהִתְכַּנֵס תוכנה קשורה

AVL

מודל וורטקס-סריג המתאים ביותר עבור תצורות אווירודינמיות אשר מורכב בעיקר של הרמה דקה ... ...

528 311 KB

הורד

Simdiv

יצירת ערכות נתונים תחת בידוד עם מודל הגירה ...

264 103 KB

הורד