אוּמסָה

הצגת ולנתח מידע גנומי בעזרת יישום זה.
הורד עכשיו

אוּמסָה דירוג וסיכום

פרסומת

  • Rating:
  • רישיון:
  • GPL
  • שם המפרסם:
  • Chris Shaw
  • מערכות הפעלה:
  • Windows NT / 2K / XP / Vista
  • גודל הקובץ:
  • 26.8 MB

אוּמסָה תגים


אוּמסָה תיאור

IMAs או מערכת ניתוח אינטראקטיבית Multigenomic הוא מערכת חדשה Visual Analytics המיועד במיוחד עבור גילוי של ידע במידע גנומי. IMAS מאפשר למדענים גנומיים לנתח במהירות קבוצה של רצפים גנומיים מיקרוביאלית באמצעות כלים כגון ניצוץ, הפיצוץ, clustalw, primer3 ו transterm ולדמיין את הפלט של כלים אלה במסגרת גנומית מאוחדת. IMAS מספק למשתמש עם ממשק גרפי תוקף 1 מימדי לרצף גנומי. המשתמש יכול לקיים אינטראקציה עם רצף כדי לנתח לנוכחות של אזורים קידוד, אשר ניתן לנתח עוד יותר על ידי יישור רצף עם מסדי נתונים מקומיים ומרוחקים באמצעות הפיצוץ. תוצאות הפיצוץ מוצגות במסגרת גרפית מאוחדת המאפשרת למשתמש לסנן ולבחור להיטים הפיצוץ של עניין. להיטי הפיצוץ שנבחרו יכול להיות אז multialigned באמצעות clustalw, ואת אלה multialignments מוצגים באמצעות מסגרת גרפית משותפת. Multialignments ו Arignments Pairwise ניתן להסרה על ידי המשתמש עבור הפניה עתידית, ודוחות HTML ניתן ליצור מציג ממצאים אלה. תכונות עיקריות: ממשק משתמש Zoomable - מהיר! פועל תוכניות ניתוח מקומית (הפיצוץ, ניצוץ, צווחים ...) IMAS הפיצוץ יכול לחפש מסד נתונים NCBI NR פועל HMMPFAM על עותק מקומי של נתוני PFAM יכול ליצור הפיצוץ dbs מ InSDSEQ קבצים XML


אוּמסָה תוכנה קשורה

פאנל

צפה בנתוני פרופיל חושיים עם תוכנה זו. ...

332 14 MB

הורד