אָב קַדמוֹן מסקנות של רצפים חומצת אמינו אבות על ידי שיטת Bayesian מבוסס מרחק
הורד עכשיו

אָב קַדמוֹן דירוג וסיכום

אָב קַדמוֹן תגים

סדר פעולות בייסיאני מנוע היקש מערכת מסקנות מטושטשת למצוא חומצות אמינו חומצת אמינו Finder. חפש חומצת אמינו Anal Analyzer חומצה רצף חומצות אמינו חומצת אמינו חומצת אמינו מתרגם בעיה להסיק לחלץ חומצות אמינו פסולת וריאציה עורך רשת Bayesian. עריכת רשת Bayesian. הסקה מסקנות הפלוטיפיות כלי הסקה פילוגנטי Bayesian AnalISIS. יישום שיטה בייס שיטת Bayesian. חומצות אמינו שאריות ניתוח מבוסס מרחק חומצת אמינו אופטימלית Phylogeny מסקנות ג 'ין אבות אשכול גן אבות ניתוח חומצות אמינו לנתח זוג חומצות אמינו חומצות אמינו מסקנת גזע גדולה חומצת אמינו ניתוח רצף ניתוח רצף חומצות אמינו סיווג חומצות אמינו חומצת אמינו טופולוגיה טופולוגיה עץ אמינו-חומצה גלאי לזהות חומצה אמינו לנתח שרשרת חומצות אמינו אבות

אָב קַדמוֹן תיאור

יישום אבות היה מתוכנן להסיק רצפים חומצת אמינו אבות של קבוצה של רצפים חומצת אמינו הומולוגית אשר יחסים phylogenetic ידועים. חבילה זו מכילה תוכנית אחת: ancestor.exe, אשר נכתב בשפה C. כדי להשתמש בתוכנית, אתה צריך קובץ קלט המכיל את רצפי חומצות אמינו ואת טופולוגיית עץ של רצפים אלה (ראה Lysozyme.Aa לדוגמה). קובץ זה מתחיל עם שני מספרים: מספר רצפים ומספר אתרי חומצות אמינו (אורך רצף). השורה השנייה תהיה שם הרצף הראשון, והקו השלישי יהיה הרצף הראשון, וכן הלאה. רק קוד אות אחד (מהוון) עבור 20 חומצות האמינו מותר ברצפים. ברצפים יש להיות מיושר פערים או כל סמלים אחרים להיות מוסר כבר. השורה האחרונה של הקובץ היא טופולוגיית עץ של רצפים. פורמט העץ הוא זהה לזה בשימוש בחבילת Phylip (Felsenstein 1995). שים לב כי העץ הוא unrroated, ולכן הפעלת ולא בתוספת נדרשת עבור הצומת העמוק ביותר

אָב קַדמוֹן תוכנה קשורה