 | LuteFiskxp.lutefiskxp הוא ANSI C תואם תוכנה המשמשת לביצוע רצף פפטיד חדש של ספקטרום מסה טנדם. |
| הורד עכשיו | |
LuteFiskxp. דירוג וסיכום
פרסומת
- רישיון:
- GPL
- מחיר:
- FREE
- שם המפרסם:
- Richard S. Johnson
- אתר האינטרנט של המוציא לאור:
- http://www.hairyfatguy.com/lutefisk/
LuteFiskxp. תגים
LuteFiskxp. תיאור
LuteFiskxp הוא ANSI C תואם תוכנה המשמשת לביצוע רצף פפטיד חדש של ספקטרום מסה טנדם. LuteFiskxp הוא ANSI C תואם תוכנה המשמשת לביצוע רצף פפטיד חדש של ספקטרום מסה טנדם. Lutefisk היא תוכנה עבור פרשנות נובו של ספקטרום CID פפטיד. איכות גבוהה טנדם מסה ספקטרום של פפטידים מתקבלים לעיתים קרובות כי אין התאמה מסד נתונים מדויק ניתן לעשות. משקאות, אנו מתמודדים עם השאלה אם החלבון תחת החקירה הוא רומן, או אם הספקטרום שאינו תואם הם לקוחות פוטנציאליים פחות מרגש כגון וריאציה בין-מינים, שגיאות רצף מסד נתונים, או שקיפות proteolytic בלתי צפויות. כדי להתחיל לטפל בבעיה זו אנו מבצעים de novinterproptation של ספקטרום CID באמצעות תוכנית המחשב lutefisk; עם זאת, כל פרשנויות כאלה כמעט תמיד מניבות מועמדים רצף מרובים, שם זה לעתים קרובות קשה או בלתי אפשרי להבחין בין רצף הנכון מן השונות שלהם. וריאציות בין רצפים מועמדים הם לעתים קרובות קטין, בדרך כלל כרוך difeptide של היפוך של אותו מסה , תחליפים של דקטיפטידים עם חומצות אמינו בודדות של אותו מסה, ותחליפים של חומצות אמינו על ידי דפלפטידים באותו מסה. אנו משתמשים במועמדים רצף מרובים המיוצרים על ידי lutefisk כמו רצפים שאילתה בתוכנית השנייה, מזייף. Ciidify היא גרסה של אלגוריתם Fasta של ביל Pearson שונה על ידי אלכס טיילור כדי להתאים את nuances MS כגון רצפים שאילתה מרובים, diageptides מעורפלים ושווי המוני isobaric.com על Unixfile עבור המערכת שלך כדי "makefile". השתמש בפקודת "הפוך LuteFisk": LuteFisk -O = מצב קובץ פלט --Q = מצב שקט (ברירת מחדל) -M = מבשר יון MASS-TS = Params קובץ PathName -r = שאריות קובץ נתיב של קובץ = pathnane של הקובץ עם רצפי מסד נתונים כדי להבקיע -v = מצב verbose ב (ברירת המחדל) -h = הדפסה זה מעודכן textwhile חדש במהדורה זו:
LuteFiskxp. תוכנה קשורה
