ביו :: עץ :: Nodei ממשק המתאר צומת עץ
הורד עכשיו

ביו :: עץ :: Nodei דירוג וסיכום

ביו :: עץ :: Nodei תגים

פרל מודול עֵץ perl צוֹמֶת ממשק פרל צומת עץ

ביו :: עץ :: Nodei תיאור

ממשק המתאר צומת עץ ביו :: עץ :: Nodei הוא ממשק Perl המתאר עץ Node.Synopsis # קבל עץ :: Nodei איכשהו # כמו מ Treio שימוש ביו :: Treeio; # קרא ב- ClustalW NJ ב Phylip / Newick פורמט שלי $ Treeio = ניו ביו :: Tree => 'Newick', -File => 'file.dnd'); העץ שלי $ = $ treadio-> next_tree; # אנו נניח שזה עבד עבור DEMO למטרות # ייתכן שתרצה לבדוק כי הוא הוגדר שלי $ rootnode = $ tree-> get_root_node; # תהליך רק הדור הבא freeach node $ שלי ($ rootnode-> כל_deScented ()) {הדפס "סניף לן הוא", $ הצומת-> Branch_Length " "} # תהליך הכל הילדים שלי $ forex_node שלי, foreach node $ שלי ($ rootnode-> get_all_descendents () {אם ($ node-> is_leaf) {הדפסה" הצומת הוא עלה ... "; # לדוגמה שימוש מתחת לדוגמה $_LAFF_NODE = $ Node אלא אם כן מוגדר $ allow_leaf_node; הדפסה "סניף לן הוא", $ Node-> Branch_Length " "} # האב הקדמון () שיטה מצביע על ההורה של הצומת # הצומת יכול רק להיות אחד הורה שלי $ הורה = allow_leaf_node-> leadestor; # ההורה לא סביר להניח שיש תיאור כי זה צומת פנימית # אבל הילד יהיה כי זה עלה להדפיס "מזהה האב:", $ הורה-> מזהה, "מזהה ילד:", $ example_leaf_node-> מזהה, " "נוצ'י מסוגל למבנה הבסיסי של בניית עץ ואחסון אורך הענף בין הצמתים, אורך הענף הוא אורך הענף בין הצומת לבין אבותיו, ולכן צומת שורש בעץ לא יהיה בדרך כלל תקף אורך סניף.מימושים של Nodei עשויה להרחיב את הפונקציות הבסיסיות ולאפשר לאחסון מידע אחר (כמו אובייקט מינים או רצפים מלאים המשמשים לבניית עץ או רצפים חלופיים). אם אינך יודע כיצד להרחיב אובייקט ביופטרל בבקשה לשאול, שמח לעזור, היינו גם מאוד מעריכים תרומות עם שיפורים או הרחבות של האובייקטים בחזרה לבסיס קוד bioperl, כך שאחרים לא צריכים להמציא את הרעיונות שלך. דרישות: · פרל

ביו :: עץ :: Nodei תוכנה קשורה