ביו :: כלים :: IPCRESS

ביו :: כלים :: IPCRESS הוא מודול Perl שיכול לנתח פלט IPCRESS ולהפוך תכונות.
הורד עכשיו

ביו :: כלים :: IPCRESS דירוג וסיכום

פרסומת

  • Rating:
  • רישיון:
  • Perl Artistic License
  • מחיר:
  • FREE
  • שם המפרסם:
  • Sendu Bala
  • אתר האינטרנט של המוציא לאור:
  • http://search.cpan.org/~sendu/

ביו :: כלים :: IPCRESS תגים


ביו :: כלים :: IPCRESS תיאור

ביו :: כלים :: IPCRESS הוא מודול Perl שיכול לנתח פלט IPCRESS ולהפוך תכונות. ביו :: כלים :: IPCRESS הוא מודול Perl שיכול לנתח את הפלט של IPCRESS ולעשות תכונות.Synopsis # עטיפת צינור ביאור פשוט עבור נתונים IPCRESS # בהנחה נתוני ה- IPCRESS כבר שנוצר בקובץ SEQ1.IPCRESS # ו- רצף הנתונים הוא בפורמט FASTA בקובץ בשם SEQ1.FA השתמש ביו :: כלים :: IPCRESS; השתמש ביו :: Seqio; שלי $ parser = ניו ביו :: כלים :: IPCRESS (-File => 'Seq1.ipcress'); שלי $ Seqio = חדש ביו :: Seqio (-Format => 'Fasta', -File => 'seq1.fa'); שלי $ $ = $ Seqio-> Next_SEQ || למות ("לא יכול לקבל אובייקט SEQ מ Seqio"); בעוד ($ $ feed = $ parser-> next_feature) {# הוסף הפנה IPCRESS לרצף $ SEQ-> add_seqfeature ($ feat); } שלי Seqout $ = חדש ביו :: Seqio (-Format => EMBL '); $ Seqout-> Write_SEQ ($ SEQ); אובייקט זה משמש כמנתח לנתוני IPCRESS, יצירת ביו :: Seqfeaturei עבור כל פגע IPCRess. אלה יכולים להיות מעובדים או להוסיף כאובייקט ביו :: SEQI לצורך ביאור אוטומטי. מודול זה מותאם מתוך ביו :: כלים :: מודולי EPCR נכתב על ידי Jason Stajich (Jason-at-bioperl.org) . · פרל


ביו :: כלים :: IPCRESS תוכנה קשורה

עלינו